草薙素子之后，巴特与侦探出身的陀古萨结为搭档。近期发生多起机器人偶杀害主人继而自杀的事件，由于受害者家属均无公诉，且死者中有政客与公安官员，于是公安9课派出巴特小组调查此案。杀人人偶皆为荒凉地带公司出品的哈德莉机型，应部分顾客要求，该机型同时具备异性玩伴的功能，巴特从荒凉地带公司出货官遇害入手，卷入与黑帮的战斗，期间有人入侵他的大脑，使其自残。 巴特决定直奔荒凉地带总部，他与陀古萨拜访了择捉岛上的黑客基姆，后者布下系统陷阱，幸有素子提出警告避免陀古萨陷入控制。依靠基姆这条线索，巴特登上了荒凉地带公司设立在海上的工厂船，素子再次降临他的身边，与其并肩作战。
17.4.3.探讨了人类生存和未来的神作。此后再无超越。 18.5.7. 肤浅，空有概念
名言警句的高级讲法。
这个简直是神作，完胜2017年的真人版
看了押井守的不少访谈，感觉他的思想确实很超前，而且这种思想是他“身体力行”出来的，《无罪》充斥着他对身体被技术假体所延伸的现状之观察，和他对身体与存在之关系性的思考。与第一部剧场版中彻底抛弃身体不同，《无罪》可以说用人偶构造出一个个“身体过剩”的场景，而主人公也从机械飞升的草薙素子，转向承认自己有限性并在这种有限性中保有自身存在的巴特身上。“身体”的意识变得无处不在，闽南风情浓重的游神段落也不再是舒缓的城市交响曲，而是让整座城市散发出一种异样的、近似于人偶的活物感。押井守爱狗，是因为狗代表着身体欲求即意识全部的前意识阶段，而意识＞身体的人类总在为自我意识的存在而自扰不已，思考从狗到人避无可避的鸿沟才是一切非人类中心主义思想的合法性之渊薮。所以押井守说：“望犬之目，见神明于其中。”
色调一改第一部的阴郁冷峻，变得华丽绚烂，格调却是一样的孤独伤感。配乐依然精彩，对白引经据典，令人刮目相看。